En diciembre de 2003 todo el Perú vibró con el título de Cienciano en la Copa Sudamericana al vencer a River Plate en la final. Pero algunos meses después, el 7 de setiembre de 2004, sería Boca Juniors, campeón de la Copa Libertadores, quien enfrentaría al cuadro cusqueño, ahora por la Recopa Sudamericana. A pesar de los éxitos del equipo xeneize, la oncena de Freddy Ternero jugó sin complejos y pudo obtener el segundo título internacional de su historia.